U zdravih ljudi mokraća u mokraćnom mjehuru je sterilna: u njoj nema bakterija niti drugih uzročnika bolesti. Mokraćna cijev, kanal kojim se mokraća izvodi iz mokraćnog mjehura izvan tijela, ne sadrži uzročnika bolesti ili ih sadrži premalo da bi izazvali infekciju. Međutim, svaki dio mokraćnog sustava može se inficirati. Ove infekcije se obično dijele na infekcije donjeg i gornjeg mokraćnog sustava; donji se odnosi na infekcije mokraćne cijevi ili mjehura a gornji na infekcije bubrega ili mokraćovoda.
Mokraćni sustav (bubrezi, mokraćovodi, mokraćni mjehur i mokraćna cijev) mogu biti ozlijeđeni probodnim ranama, tupom silom, liječenjem zračenjem ili kirurškim zahvatom.
Začepljenje bilo gdje unutar mokraćnog sustava―od bubrega, gdje se mokraća stvara, do mokraćne cijevi, kroz koju mokraća izlazi iz tijela―može povećati tlak unutar mokraćnog sustava i usporiti protok mokraće. Začepljenje mokraćnog sustava može također dovesti do infekcija mokraćnog sustava, stvaranja kamenaca i smanjenog rada bubrega. Infekcija se može razviti jer bakterije, koje ulaze u mokraćni sustav ne budu isprane iz njega van kada je mokraćni sustav začepljen.